1951年9月，西南地区第一家农村信用社——璧山县狮子乡信用社成立，揭开了重庆农村合作金融发展史册的第一页。

1996年8月，农村信用社与农业银行脱离行政关系。由农村金融体制改革领导小组下设的办公室（简称农改办）负责全市农村信用社的改革与管理工作。

2000年3月，重庆市农村信用社联合社成立。是全国首批成立的6家省级联社之一，履行对全市农村合作金融机构的管理职能。同时，撤销农改办。其他5家为北京、上海、天津、宁夏、江苏。

2003年8月，重庆市农村信用社被确定为全国农村信用社首批8家改革试点单位之一，拉开了深化农村信用社改革的新一轮序幕。另外7家分别是浙江、山东、江西、贵州、吉林、陕西和江苏省。

2005年11月，重庆首家农村合作银行——武隆农村合作银行正式成立。

2007年9月，在重庆农村信用社基础上组建重庆农商行工作正式启动。

2008年6月，经国务院同意、中国银监会批准，重庆农村商业银行股份有限公司正式成立。